Как заполнить декларацию по НДС при корректировке оплаты новому контрагенту, учитывая операции разных кварталов?

Добрый день! Проясните пожалуйста ситуацию в части НДС и верного заполнения декларации по НДС:
Был заключен договор на строительные работы между нашей компанией и застройщиком, от имени которого действует организация на основании их агентского договора (далее по тексту компания А). Оплата поступала от компании А на р/с нашей компании во 2 квартале. Реализация в 3 квартале выписывается на Застройщика (так указано в договоре).  В том же 3 квартале до реализации я провожу корректировку долга на застройщика с видом операции "перенос задолженности" 
Подскажите пожалуйста корректно ли это? Правильно ли получается, что в книге покупок данный аванс отражается 2 раза ?